孔板流量计和其他的流量计一样，故障都是通过它的输出信号反应出来的，所以分析判断故障原因大多都是从输出信号的异常现象入手的。一体化孔板流量计有很多种检测方式和检测技术。所采用的检测元件也是多种多样的，与各种检测元件配套的测量电路，也有较大的差别，所以说当仪器出现问题的时候，表现的形式也是各有不同的。但是这些不同都是仅限于孔板流量计的前面部分（就是检测元件和前置放大电路部分）。后面的信号处理部分，如滤波电路，整形电路，a/D转换和微处理器，显示单元等都是相似的。所以常见故障也都具有共性。

通电后，无流量时有输出信号。这种现象往往有以下几种表现形式：
（1）处于间歇工作状态的流量计，电源未端，阀门关闭，输出信号不回零；这种现象可能的原因与第一种现象相同，主要原因可能是管道振荡影响和外界电磁干扰。应该采取调低转换器的灵敏度，提高整形电炉的触发电平，可抑制噪声，克服间隙期间的误触发。
（2）接通电源，阀门未开，有输出信号；产生这种故障的原因可能就是外界的干扰，因此当出现这些问题的时候，我们应采取的措施是加强屏蔽和接地，消除管道振动，调整降低转换器的灵敏度。
（3）通电状态下，关闭下有阀门，输出不回零，关上游阀门输出回零；这主要来自流量计上游流体脉动压力的影响。
（4）通电状态下，关上游阀门输出不回零，只有关下游阀门输出回零；这种故障是管内流体扰动引起的，扰动来自孔板流量计下游管道。出现这样的故障的时候我们的解决办法就是下游直管段，减小六条扰动的影响。